کمپرسورهای هیدروژن را می توان بر اساس اصل عملکرد خود به دو نوع تقسیم کرد: جابجایی مثبت و دینامیکی که جابجایی مثبت رایج ترین آنهاست. کمپرسورهای جابجایی مثبت بیشتر به کمپرسورهای پیستونی رفت و برگشتی و کمپرسورهای دوار تقسیم می‌شوند. کمپرسورهای پیستونی دارای سابقه طولانی و فناوری تولید بالغ هستند. 2. کمپرسورهای روتاری شامل کمپرسورهای چرخشی پره ای (پره کشویی) و کمپرسورهای اسکرو هستند. اکثر کولرهای گازی تولید داخل از کمپرسورهای دوار استفاده می کنند. کمپرسورهای اسکرو عمدتاً در تجهیزات تبرید بزرگ مورد استفاده قرار می گیرند و همچنین به طور گسترده در مراکز خرید بزرگ و ساختمان های اداری مورد استفاده قرار می گیرند.
مانند گازهای دیگر، هیدروژن را می توان با استفاده از کمپرسورهای رفت و برگشتی یا گریز از مرکز برای برآوردن نیازهای فرآیند تحت فشار قرار داد. در هر کاربرد معمولی، نوع کمپرسور باید بر اساس دبی هیدروژن و فشار مورد نیاز تعیین شود. برای واحدهای هیدروکراکینگ با اندازه بزرگ و متوسط، از کمپرسورهای رفت و برگشتی برای هیدروژن جدید استفاده می شود، در حالی که از کمپرسورهای گریز از مرکز برای هیدروژن در گردش استفاده می شود.